Stefán Jónsson var biskup í Skálholti 1491–1518.
Stefán reyndi m.a að leggja vegi við Skálholt. Hann lést árið sem Lúter hengdi upp greinarnar þar sem hann fyrst gagnrýndi kirkjuna í Róm.
Margt bendir til að Stefán hafi einnig verið ósammála kirkjuyfirvöldum í Róm og vildi ekki að hér væru fulltrúar Rómversku kirkjunnar að selja aflátsbréf.
